با توجه به این که پژوهشکده علوم محیطی با اهداف پژوهشی بین رشته‌ایی فعالیت خود را آغاز و با موفقیت ادامه داده است؛ لذا فصلنامه علمی-پژوهشـی علوم محیطی نیز چنین هدفی را دنبال نموده و به انتشار پژوهش‌هایی با نوآوری درخور و شایسته در زمینه‌های زیر می‌پردازد: آلودگی محیط زیست؛ کشاورزی اکولوژیک؛ حقوق محیط زیست؛ اقتصاد محیط زیست و منابع طبیعی؛ تنوع زیستی و مدیریت اکوسیستم‌ها؛ آموزش، ترویج و مدیریت محیط زیست؛ برنامه‌ریزی، طراحی و ارزیابی محیط زیست.